В статье рассматриваются вопросы формирования системы институтов, способных обеспечить достижение основных приоритетов пространственного развития Российской Федерации в части содействия модернизации регионального звена российской экономики, поддержания единства экономического пространства страны на инновационной основе. Важной частью этой системы выступают региональные институты развития, которые позволяют согласовать общегосударственные приоритеты модернизации экономики с особенностями хозяйственного и социального развития отдельных субъектов Российской Федерации. Это делает региональные институты развития одним из связующих звеньев между федеральным уровнем социально-экономического стратегирования и стратегическими планами субъектов Российской Федерации.